Grantové projekty a výzkumná spolupráce
Přehled výzkumných projektů, na jejichž řešení se podílím nebo jsem se podílel, se zaměřením zejména na nádory hlavy a krku, nádorové mikroprostředí, prognostické a prediktivní biomarkery a nové diagnostické či terapeutické přístupy.
U každého projektu jsou uvedeni formální řešitelé a spoluřešitelé
(odpovědné osoby za jednotlivé zapojené instituce) a samostatně moje role.
U projektů, kde nejsem formálně řešitelem či spoluřešitelem, je uvedeno moje zapojení v týmu FN Motol.
Aktuálně řešené projekty
2026–2029 · probíhá
Souhra dynamiky cytoskeletu a metabolického přeprogramování:
Biofyzikální reflexe EMT ve vimentinu a aktinu u karcinomu hlavy a krku jako základ pro stratifikaci rizika
Instituce: Lékařská fakulta Masarykovy univerzity · Fakultní nemocnice v Motole
- doc. MUDr. Jaromír Gumulec, Ph.D. – hlavní řešitel, LF MU
- prof. MUDr. Jan Plzák, Ph.D. – spoluřešitel / odpovědná osoba, FN Motol
Publikace dedikované projektu
Projekt byl zahájen v roce 2026; v oficiálním veřejném přehledu zatím nejsou evidovány publikační výstupy.
AZV / MZ ČR
2022–2026 · probíhá
Proteom extracelulárních vezikul – neprozkoumaná oblast mezibuněčné komunikace v mikroprostředí nádorů hlavy a krku
Instituce: Lékařská fakulta Masarykovy univerzity · Fakultní nemocnice v Motole
- Mgr. Martina Raudenská, Ph.D. – hlavní řešitelka, LF MU
- prof. MUDr. Jan Plzák, Ph.D. – spoluřešitel / odpovědná osoba, FN Motol
Publikace dedikované projektu
- Orchestrating movement: the role of Caveolin-1 in migration and metastasis. Molecular Cancer, 2025.
- Protein cargo in extracellular vesicles as the key mediator in the progression of cancer. Cell Communication and Signaling, 2024.
- Autophagy modulators influence the content of important signalling molecules in PS-positive extracellular vesicles. Cell Communication and Signaling, 2023.
- Cancer-associated fibroblasts: Mediators of head and neck tumor microenvironment remodeling. BBA – Reviews on Cancer, 2023.
2023–2026 · probíhá
Složení ústního a střevního mikrobiomu jako prediktor odpovědi na léčbu
u pacientů s karcinomem hlavy a krku
Instituce: Fakultní nemocnice v Motole · Lékařská fakulta Masarykovy univerzity
- prof. MUDr. Jan Plzák, Ph.D. – hlavní řešitel, FN Motol
- prof. RNDr. Michal Masařík, Ph.D. – spoluřešitel / odpovědná osoba, LF MU
Publikace a odborné výstupy dedikované projektu
- Shaping death: how the microbiome regulates tumour cell demise and therapy response. Cancer and Metastasis Reviews, 2026.spoluautor D. Kalfeřt
- Interplay Between Oral and Gut Microbiomes in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma: Insights into Dysbiosis and Tumour Microenvironment Modulation. konferenční výstup, 2025.spoluautor D. Kalfeřt
- Analysis of the oral and intestinal microbiome composition in patients with head and neck cancer. konferenční výstup, 2024.spoluautor D. Kalfeřt
- The interplay between microbiome and host factors in pathogenesis and therapy of head and neck cancer. BBA – Reviews on Cancer, 2024.spoluautor D. Kalfeřt
2023–2026 · probíhá
Prognostický význam signalizace receptoru pro epidermální růstový faktor
u dlaždicových karcinomů hlavy a krku
Hlavní příjemce: Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i. · spolupráce s FN Motol
- Mgr. Michal Kolář, Ph.D. – hlavní řešitel, ÚMG AV ČR
- prof. MUDr. Jan Plzák, Ph.D. – spoluřešitel / odpovědná osoba za klinickou část, FN Motol
Veřejný přehled STARFOS eviduje celkem 3 účastníky projektu; jména odpovědných osob všech účastníků nejsou na veřejném detailu projektu zobrazena.
Publikace / výsledky dedikované projektu
- Rhomboid protease RHBDL2 is a calcium-activated suppressor of EGFR signalling in keratinocytes. Cellular and Molecular Life Sciences, 2026.
- Comparison of holotomographic microscopy and coherence-controlled holographic microscopy. Journal of Microscopy, 2024; dedikace projektu NU23-03-00557 byla doplněna publikační korekcí.
Ukončené projekty
2024–06/2026
Nový diagnostický nástroj pro stanovování intratumorálního mikrobiomu
Instituce: ESSENCE LINE, s.r.o. · LF MU · FN Motol · Výzkumný ústav potravinářský Praha
- Ing. Petr Novotný – ESSENCE LINE, s.r.o.
- prof. RNDr. Michal Masařík, Ph.D. – LF MU
- MUDr. David Kalfeřt, Ph.D. – FN Motol
- Ing. Marián Urban, Ph.D. – Výzkumný ústav potravinářský Praha
Publikace dedikované projektu
- The interplay between microbiome and host factors in pathogenesis and therapy of head and neck cancer. BBA – Reviews on Cancer, 2024.spoluautor D. Kalfeřt
2021–2024
Funkční nanoroboti pro navigovanou kombinovanou nádorovou terapii
Instituce: LF MU · VŠCHT Praha · Univerzita Karlova · FN Motol
- RNDr. Michaela Fojtů, Ph.D. – LF MU
- RNDr. Martin Pumera, Ph.D. – VŠCHT Praha
- Ing. Milan Jakubek, Ph.D. – Univerzita Karlova
- MUDr. David Kalfeřt, Ph.D. – FN Motol
Vybrané recenzované publikace dedikované projektu
- Interaction of Selected Anthracycline and Tetracycline Chemotherapeutics with Poly(I:C) Molecules. ACS Omega, 2025.
- Curcumin: A Potential Weapon in the Prevention and Treatment of Head and Neck Cancer. ACS Pharmacology & Translational Science, 2024.
- Cyanine dyes in the mitochondria-targeting photodynamic and photothermal therapy. Communications Chemistry, 2024.
- Investigation of the potential effects of estrogen receptor modulators on immune checkpoint molecules. Scientific Reports, 2024.
- Iron chelators as mitophagy agents. Biomedicine & Pharmacotherapy, 2024.
- Engine shutdown: migrastatic strategies and prevention of metastases. Trends in Cancer, 2023.
- Magnetically Driven Self-Degrading Zinc-Containing Cystine Microrobots for Treatment of Prostate Cancer. Small, 2023.
- Pentamethinium salts suppress key metastatic processes by regulating mitochondrial function and inhibiting dihydroorotate dehydrogenase respiration. Biomedicine & Pharmacotherapy, 2022.
- Pollen-Based Magnetic Microrobots are Mediated by Electrostatic Forces to Attract, Manipulate, and Kill Cancer Cells. Advanced Functional Materials, 2022.
- Self-Propelled Magnetic Dendrite-Shaped Microrobots for Photodynamic Prostate Cancer Therapy. Angewandte Chemie International Edition, 2022.
Kompletní soupis evidovaných výsledků je dostupný na oficiální stránce projektu.
2021–2024
Vynikající hodnocení projektu
Vliv metabolického reprogramování fibroblastů asociovaných s nádorem na prognózu pacientů s nádory hlavy a krku
Instituce: Lékařská fakulta Masarykovy univerzity · Fakultní nemocnice v Motole
- prof. RNDr. Michal Masařík, Ph.D. – hlavní řešitel, LF MU
- prof. MUDr. Jan Betka, DrSc., FCMA – spoluřešitel / odpovědná osoba, FN Motol
Projekt naplnil všechny cíle a výsledky byly publikovány mimo jiné v impaktovaných časopisech Q1/D1.
Publikace dedikované projektu
- Glutamine and serum starvation alters the ATP production, oxidative stress, and abundance of mitochondrial RNAs in extracellular vesicles produced by cancer cells. Scientific Reports, 2024.spoluautor D. Kalfeřt
- Short-term autophagy inhibition by autophinib or SAR405 does not alter the effect of cisplatin on ATP production in prostate cancer cells. Bratislava Medical Journal, 2024.
- BRAF mutation, selected miRNAs and genes expression in primary papillary thyroid carcinomas and local lymph node metastases. 2024; explicitní grantová dedikace NU21-03-00223.spoluautor D. Kalfeřt
- Engine shutdown: migrastatic strategies and prevention of metastases. Trends in Cancer, 2023.
- Advances in Cancer Metabolism and Tumour Microenvironment. International Journal of Molecular Sciences, 2022.
- Metabolic tricks of cancer cells. BBA – Reviews on Cancer, 2022.
- Metabolická plasticita nádorových buněk. Klinická onkologie, 2022.
2021–2023
Metabolic symbiosis between cancer cells and cancer-associated fibroblasts in head and neck cancer
Instituce: Lékařská fakulta Masarykovy univerzity · Fakultní nemocnice v Motole
- prof. RNDr. Michal Masařík, Ph.D. – hlavní řešitel, LF MU
- prof. MUDr. Jan Betka, DrSc., FCMA – spoluřešitel / odpovědná osoba, FN Motol
Publikace dedikované projektu
- Glutamine and serum starvation alters the ATP production, oxidative stress, and abundance of mitochondrial RNAs in extracellular vesicles produced by cancer cells. Scientific Reports, 2024.spoluautor D. Kalfeřt
- Protein cargo in extracellular vesicles as the key mediator in the progression of cancer. Cell Communication and Signaling, 2024.
- RNAs in tumour-derived extracellular vesicles and their significance in the tumour microenvironment. International Journal of Cancer, 2024.spoluautor D. Kalfeřt
- Autophagy modulators influence the content of important signalling molecules in PS-positive extracellular vesicles. Cell Communication and Signaling, 2023.
- Cancer-associated fibroblasts: Mediators of head and neck tumor microenvironment remodeling. BBA – Reviews on Cancer, 2023.
- Engine shutdown: migrastatic strategies and prevention of metastases. Trends in Cancer, 2023.
- Advances in Cancer Metabolism and Tumour Microenvironment. International Journal of Molecular Sciences, 2022.
- Metabolic tricks of cancer cells. BBA – Reviews on Cancer, 2022.
- Crosstalk between autophagy inhibitors and endosome-related secretory pathways: a challenge for autophagy-based treatment of solid cancers. Molecular Cancer, 2021.
AZV / MZ ČR
2020–2023
Exosomální RNA produkovaná fibroblasty asociovanými s nádorem jako relevantní marker v prognóze nádorů hlavy a krku
Instituce: Lékařská fakulta Masarykovy univerzity · Fakultní nemocnice v Motole
- RNDr. Jan Balvan, Ph.D. – hlavní řešitel, LF MU
- prof. MUDr. Jan Betka, DrSc., FCMA – spoluřešitel / odpovědná osoba, FN Motol
Publikace dedikované projektu
- Glutamine and serum starvation alters the ATP production, oxidative stress, and abundance of mitochondrial RNAs in extracellular vesicles produced by cancer cells. Scientific Reports, 2024.spoluautor D. Kalfeřt
- RNAs in tumour-derived extracellular vesicles and their significance in the tumour microenvironment. International Journal of Cancer, 2024.spoluautor D. Kalfeřt
- Autophagy modulators influence the content of important signalling molecules in PS-positive extracellular vesicles. Cell Communication and Signaling, 2023.
- Cell death in head and neck cancer pathogenesis and treatment. Cell Death & Disease, 2021.
- Crosstalk between autophagy inhibitors and endosome-related secretory pathways: a challenge for autophagy-based treatment of solid cancers. Molecular Cancer, 2021.
AZV / MZ ČR
2018–2021
Vynikající hodnocení projektu
Interakce buněk nádorového mikroprostředí jako nový nástroj predikce účinnosti terapie nádorů hlavy a krku
Instituce: Fakultní nemocnice v Motole · Lékařská fakulta Masarykovy univerzity
- prof. MUDr. Jan Betka, DrSc., FCMA – hlavní řešitel, FN Motol
- prof. RNDr. Michal Masařík, Ph.D. – spoluřešitel / odpovědná osoba, LF MU
Poskytovatel vyzdvihl množství a kvalitu originálních výsledků; publikace projektu dosáhly souhrnného IF 72,01.
Vybrané recenzované publikace dedikované projektu
- mRNA Subtype of Cancer-Associated Fibroblasts Significantly Affects Key Characteristics of Head and Neck Cancer Cells. Cancers, 2022.spoluautor D. Kalfeřt
- Sensitivity to Cisplatin in Head and Neck Cancer Cells Is Significantly Affected by Patient-Derived Cancer-Associated Fibroblasts. International Journal of Molecular Sciences, 2021.spoluautor D. Kalfeřt
- Caveolin-1 in oncogenic metabolic symbiosis. International Journal of Cancer, 2020.
- Effect of tumor microenvironment on pathogenesis of the head and neck squamous cell carcinoma: a systematic review. Molecular Cancer, 2019.
- Prognostic Significance of Serum Free Amino Acids in Head and Neck Cancers. Cells, 2019.spoluautor D. Kalfeřt
- Unexpected therapeutic effects of cisplatin. Metallomics, 2019.
STARFOS eviduje u projektu celkem 16 výsledků; zde jsou uvedeny hlavní recenzované publikace relevantní k tématu HNSCC.
2018–2020
Efekt buněčné tuhosti a mikroprostředí jako prediktor odpovědi na léčbu karcinomů hlavy a krku
Instituce: LF MU · Univerzita Karlova · FN Motol · FN u sv. Anny v Brně
- doc. MUDr. Jaromír Gumulec, Ph.D. – LF MU
- prof. MUDr. Jan Plzák, Ph.D. – Univerzita Karlova / klinická část projektu
FN Motol a FN u sv. Anny v Brně jsou ve veřejném záznamu vedeny jako další zapojené organizace; detail projektu MUNI u nich neuvádí samostatnou odpovědnou osobu.
Vybrané recenzované publikace dedikované projektu
- mRNA Subtype of Cancer-Associated Fibroblasts Significantly Affects Key Characteristics of Head and Neck Cancer Cells. Cancers, 2022.spoluautor D. Kalfeřt
- Cell death in head and neck cancer pathogenesis and treatment. Cell Death & Disease, 2021.
- Mechanobiologie kancerogeneze. Klinická onkologie, 2021.
- Sensitivity to Cisplatin in Head and Neck Cancer Cells Is Significantly Affected by Patient-Derived Cancer-Associated Fibroblasts. International Journal of Molecular Sciences, 2021.spoluautor D. Kalfeřt
- Caveolin-1 in oncogenic metabolic symbiosis. International Journal of Cancer, 2020.
- Effect of tumor microenvironment on pathogenesis of the head and neck squamous cell carcinoma: a systematic review. Molecular Cancer, 2019.
- Prognostic Significance of Serum Free Amino Acids in Head and Neck Cancers. Cells, 2019.spoluautor D. Kalfeřt
- Unexpected therapeutic effects of cisplatin. Metallomics, 2019.
Kompletní seznam evidovaných výsledků je dostupný přes odkazy na MUNI a STARFOS.
Vlastní grantová podpora během doktorského studia
Procházkova cena za rok 2014, Kutvirtova cena za rok 2014,
Ocenění primátora města Hradec Králové za studentskou a tvůrčí činnost za rok 2015
a Kutvirtova cena za rok 2015. Ocenění se vztahují k publikačním výstupům
disertačního výzkumu zaměřeného na prognostické a prediktivní markery nádorů hlavy a krku.
Více informací ↗
GA UK
projekt založen 2011
vlastní grant
Analýza vybraných prognostických a prediktivních markerů u karcinomů orofaryngu a hrtanu
Instituce: Lékařská fakulta UK v Hradci Králové
- MUDr. David Kalfeřt – hlavní řešitel projektu
práce The Role of Protein p16 in Glottic Laryngeal Squamous Cell Carcinoma
byla součástí publikačního souboru oceněného Procházkovou cenou za rok 2014
a Kutvirtovou cenou za rok 2014.
Vybrané výstupy projektu
- Kalfeřt D., Ludvíková M. Nádorové markery u dlaždicových karcinomů hlavy a krku. Onkologie, 2013; 5:241–246.
- Kalfeřt D., Kašparová P., Čelakovský P. Extranodální NK/T buněčný lymfom nazálního typu – neobvyklá příčina jednostranné nosní obstrukce. Otorinolaryngologie a foniatrie, 2012.
- Kalfeřt D., Čelakovský P., Laco J., Ludvíková M. The Role of Protein p16 in Glottic Laryngeal Squamous Cell Carcinoma. Pathology & Oncology Research, 2014;20:909–915.
- Kalfeřt D. et al. Význam exprese galektinu-3 u glotického dlaždicobuněčného karcinomu hrtanu. práce s explicitní dedikací GAUK 444311.
LF UK v Hradci Králové
2010
vlastní interní grant
Interní grantová podpora disertačního projektu – prognostické a prediktivní markery u nádorů hlavy a krku
Instituce: Lékařská fakulta UK v Hradci Králové
- MUDr. David Kalfeřt – řešitel / příjemce interní grantové podpory
Procházkova cena 2014 a Kutvirtova cena 2014 za publikační soubor zahrnující práce
o p16 a sérových MMP; v roce 2015 následovalo Ocenění primátora města Hradec Králové
za studentskou a tvůrčí činnost a Kutvirtova cena za publikaci
MicroRNA Profile in Site-specific Head and Neck Squamous Cell Cancer.
Vybrané navazující publikační výstupy disertačního výzkumu
- Kalfeřt D. et al. Analysis of preoperative serum levels of MMP1, -2, and -9 in patients with site-specific head and neck squamous cell cancer. Anticancer Research, 2014;34:7431–7441.
- Kalfeřt D. et al. The Role of Protein p16 in Glottic Laryngeal Squamous Cell Carcinoma. Pathology & Oncology Research, 2014;20:909–915.
- Kalfeřt D. et al. MicroRNA Profile in Site-specific Head and Neck Squamous Cell Cancer. Anticancer Research, 2015;35:2455–2463.
Podpora „Grantu s podporou vnitřní soutěže Lékařské fakulty UK v Hradci Králové 2010“
je uvedena v disertační práci; samostatné registrační číslo tohoto interního grantu
se v dostupných veřejných zdrojích nepodařilo dohledat.
Poznámka k terminologii: označení řešitel/spoluřešitel je použito pro formální
odpovědné osoby projektu za jednotlivé příjemce či spolupříjemce. Běžní členové výzkumných
týmů nejsou v této části uváděni jako spoluřešitelé. Publikační seznamy vycházejí z veřejných
záznamů MUNI, STARFOS/CEP, GA UK a z explicitních grantových dedikací v publikacích.
Aktualizováno v říjnu 2026.
